Ανακοινώθηκε μετά από κλήρωση το πλήρης πρόγραμμα για το πρωτάθλημα της Σούπες Λίγκας για την περίοδο 2012-2013. Οι αγωνιστικές διαμορφώθηκαν ως εξής:
1η αγωνιστική
Πανιώνιος – Αρης 1-0
Βέροια – Ολυμπιακός 1-2
ΟΦΗ – Ξάνθη 0-0
Λεβαδειακός – Παναθηναϊκός 0-1
ΑΕΚ – Αστέρας Τρίπολης 0-1
ΠΑΣ Γιάννινα – Πλατανιάς 0-0
Κέρκυρα – Ατρόμητος 0-2
ΠΑΟΚ – Πανθρακικός 1-0
2η αγωνιστική
Βέροια – Πανιώνιος 0-1
Αρης – ΟΦΗ 0-0
Ολυμπιακός – Λεβαδειακός 4-0
Ξάνθη – ΑΕΚ 1-0
Παναθηναϊκός – ΠΑΣ Γιάννινα 1-1
Αστέρας Τρίπολης – Κέρκυρα 3-0
Πλατανιάς – Πανθρακικός 2-0
Ατρόμητος – ΠΑΟΚ 1-0
3η αγωνιστική
Λεβαδειακός – Βέροια 0-0
ΑΕΚ – Αρης 1-1
ΠΑΣ Γιάννινα – Ολυμπιακός 1-2
Κέρκυρα – Ξάνθη 1-1
Πανθρακικός – Παναθηναϊκός 1-0
ΠΑΟΚ – Αστέρας Τρίπολης 2-1
Πλατανιάς – Ατρόμητος 0-0
Πανιώνιος – ΟΦΗ 2-1
4η αγωνιστική
Λεβαδειακός – Πανιώνιος 3-0
ΟΦΗ – ΑΕΚ 2-1
Βέροια – ΠΑΣ Γιάννινα 1-0
Αρης – Κέρκυρα 1-0
Ολυμπιακός – Πανθρακικός 4-1
Ξάνθη – ΠΑΟΚ 0-3
Παναθηναϊκός – Ατρόμητος 1-1
Αστέρας Τρίπολης – Πλατανιάς 2-1
5η αγωνιστική
Πανιώνιος – ΑΕΚ 1-0
Κέρκυρα – ΟΦΗ 2-1
Ατρόμητος – Ολυμπιακός 0-1
Πανθρακικός – Βέροια 0-1
ΠΑΟΚ – Αρης 4-1
Πλατανιάς – Ξάνθη 3-2
Παναθηναϊκός – Αστέρας Τρίπολης 0-0
ΠΑΣ Γιάννινα – Λεβαδειακός
6η αγωνιστική
ΠΑΣ Γιάννινα – Πανιώνιος
ΑΕΚ – Κέρκυρα
Λεβαδειακός – Πανθρακικός
ΟΦΗ – ΠΑΟΚ
Βέροια – Ατρόμητος
Αρης – Πλατανιάς
Ολυμπιακός – Αστέρας Τρίπολης
Ξάνθη – Παναθηναϊκός
7η αγωνιστική
Πανιώνιος – Κέρκυρα
Πανθρακικός – ΠΑΣ Γιάννινα
ΠΑΟΚ – ΑΕΚ
Ατρόμητος – Λεβαδειακός
Πλατανιάς – ΟΦΗ
Αστέρας Τρίπολης – Βέροια
Παναθηναϊκός – Αρης
Ολυμπιακός – Ξάνθη
8η αγωνιστική
Πανθρακικός – Πανιώνιος
Κέρκυρα – ΠΑΟΚ
ΠΑΣ Γιάννινα – Ατρόμητος
ΑΕΚ – Πλατανιάς
Λεβαδειακός – Αστέρας Τρίπολης
ΟΦΗ – Παναθηναϊκός
Βέροια – Ξάνθη
Αρης – Ολυμπιακός
9η αγωνιστική
Πανιώνιος – ΠΑΟΚ
Ατρόμητος – Πανθρακικός
Πλατανιάς – Κέρκυρα
Αστέρας Τρίπολης – ΠΑΣ Γιάννινα
Παναθηναϊκός – ΑΕΚ
Ξάνθη – Λεβαδειακός
Ολυμπιακός – ΟΦΗ
Αρης – Βέροια
10η αγωνιστική
Ατρόμητος – Πανιώνιος
ΠΑΟΚ – Πλατανιάς
Πανθρακικός – Αστέρας Τρίπολης
Κέρκυρα – Παναθηναϊκός
ΠΑΣ Γιάννινα – Ξάνθη
ΑΕΚ – Ολυμπιακός
Λεβαδειακός – Αρης
ΟΦΗ – Βέροια
11η αγωνιστική
Πανιώνιος – Πλατανιάς
Αστέρας Τρίπολης – Ατρόμητος
Παναθηναϊκός – ΠΑΟΚ
Ξάνθη – Πανθρακικός
Ολυμπιακός – Κέρκυρα
Αρης – ΠΑΣ Γιάννινα
Βέροια – ΑΕΚ
ΟΦΗ – Λεβαδειακός
12η αγωνιστική
Αστέρας Τρίπολης – Πανιώνιος
Πλατανιάς – Παναθηναϊκός
Ατρόμητος – Ξάνθη
ΠΑΟΚ – Ολυμπιακός
Πανθρακικός – Αρης
Κέρκυρα – Βέροια
ΠΑΣ Γιάννινα – ΟΦΗ
ΑΕΚ – Λεβαδειακός
13η αγωνιστική
Πανιώνιος – Παναθηναϊκός
Ξάνθη – Αστέρας Τρίπολης
Ολυμπιακός – Πλατανιάς
Αρης – Ατρόμητος
Βέροια – ΠΑΟΚ
ΟΦΗ – Πανθρακικός
Λεβαδειακός – Κέρκυρα
ΑΕΚ – ΠΑΣ Γιάννινα
14η αγωνιστική
Ξάνθη – Πανιώνιος
Παναθηναϊκός – Ολυμπιακός
Αστέρας Τρίπολης – Αρης
Πλατανιάς – Βέροια
Ατρόμητος – ΟΦΗ
ΠΑΟΚ – Λεβαδειακός
Πανθρακικός – ΑΕΚ
Κέρκυρα – ΠΑΣ Γιάννινα
15η αγωνιστική
Πανιώνιος – Ολυμπιακός
Αρης – Ξάνθη
Βέροια – Παναθηναϊκός
ΟΦΗ – Αστέρας Τρίπολης
Λεβαδειακός – Πλατανιάς
ΑΕΚ – Ατρόμητος
ΠΑΣ Γιάννινα – ΠΑΟΚ
Κέρκυρα – Πανθρακικός